民國前九年於台南廳大目降(現台南縣新化鎮)設立甘蔗試作場。
民國二十一年合併各糖業研究單位成立「糖業試驗所」,並由大目降遷至台南竹高厝,於日治時代直屬台灣總督府。
民國三十四年台灣光復,糖業試驗所由台灣行政長官公署接收,改組為「台灣省糖業試驗所」。
民國三十七年奉台灣省政府令本所改隸台灣糖業公司,名稱改為「台灣糖業試驗所」。
民國六十二年本所更名為「台灣糖業研究所」,為教育部認可之學術研究單位。
民國八十八年七月奉公司精簡組織決策,原台灣糖業研究所與台糖畜產研究所合併為「台糖公司研究所」。
民國九十一年三月,研究所歡度甘蔗研究一百年。
民國九十三年十二月,組織精簡,成立以生物科技、藥用植物研發為導向之研究單位。




































本所目前編制設所長室、工程組、化學組、生物組、產業資訊組、總務課、人事、會計及政風等部門。部門簡介如下:
1、工程組
 



以開發量產製造程序為主要任務,並提供台糖公司事業部技術服務。工程組承接化學組或生物組開發成果,利用化學工程技術進行製造程序之設計,試驗中間工廠(pilot plant)提供醱酵製程與分離純化製程放大所需之硬體設備。目前設備包括6000公升體積之微生物生物反應器兩座,100-700公升生物反應器4座,周邊分離設備等。
2、化學組
 



以化學及生物化學技術為基礎,尋求本土性可開發藥用植物及本所培養之食藥用菌絲體,進行檢測、鑑定、篩選、分離及分析具有市場價值之特用化學物質,進而開發高價衍生化合物,並研發實驗室新製程,移轉至中間實驗室進行製程放大與量化生產。專長領域包括分子生物學,蛋白質純化,化學分析與鑑定,天然物有效成分之單離及純化,有機化學合成。
3、生物組
 配合公司政策整併花卉及農業技術研發業務而成立生物組,主要任務為配合各事業部及中心開發農業生產技術,並提供技術服務。研究方向包括蝴蝶蘭產業技術以及藥用植物產業技術兩方面,在蝴蝶蘭產業技術方面主要承接農業委員會計畫補助,建構蝴蝶蘭上游產業鏈之技術服務,提供包括去病毒及組織培養之技術服務;在藥用植物產業技術方面,配合中草藥產業之推動,由化學品系選育、種苗繁殖、田間栽培及採收後處理等技術之建立,提供藥用植物優良農業栽培規範(Good Agricultural Practice, GAP)之關鍵技術。
4、產業資訊組
 產資組任務主要協助研究開發所需之資訊資源提供及研究成果之智慧財產管理、應用。研究方面協助事業部及研發部門進行研究計畫執行所需之產業資訊蒐集/分析暨專利檢索/分析之委託,並提供組織研發所需之知識管理系統及相關資訊管理作業流程與環境。智慧財產方面包括研究業務之對外窗口,研究成果之智慧財產權的管理維護、推廣、技術移轉(授權)、圖書館業務(館際合作)等服務。本所已通過經濟部「台灣智慧財產管理系統」(TIPS)驗證,為經濟部國營事業機構第一家通過TIPS驗證單位。
5、總務課
 總務課是一個最佳行政團隊組合:內含文書、採購、出納、公關、資產、物料、消防、公差宿舍管理、所區安全防護、環境清潔、庭園景觀維護、博物館參觀導覽、房舍水電修理等多項業務,除全力依公司政策貫徹執行及一般行政工作運轉承接外,以配合本所研究業務為主要重點。對外為本所糖業博物館接受參觀登記窗口,並為所區市定古蹟建築、老大樹木植物景觀等參觀資源整合及相關業務安排。






























































































































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