社團法人台灣濕地保護聯盟為一全國性社團法人組織，其宗旨在致力濕地與其相關生態保護之工作，並結合台灣各社運與生態團體來共同推廣環境保護運動。自1996年2月11日正式成立以來，在歷任理事長（曾瀧永醫師、王靖波先生、吳俊忠教授、邱文彥教授、翁義聰教授）與全體理監事全力推動下，台灣濕地保護聯盟不斷投身濕地保育任務。我們希望由濕地保護著手，為台灣瀕臨瓦解邊緣的生態環境盡力。濕盟目前的主要工作方向為：推動重要濕地之指定與保護、特定物種之保育、濕地復育與經營管理、環境教育與培訓等4項。
1. 重要濕地之指定與保護
希望透過台灣濕地資料庫的建制，將各個濕地依據不同法規(如：野生動物保育法、文化資產保存法等)，依照保護區、國家風景區或公園的型式，讓濕地取得法律上的地位，進而被保護起來，以利後續之管理與使用。濕盟剛成立時的主要工作就是劃設保護區，陸續與學者專家、保育團體一起成功地劃設了七股黑面琵鷺保護區、四草野生動物保護區、台南新市燕鴴保護區、鳥松濕地公園、洲仔濕地公園、半屏湖濕地公園等。
2. 特定物種保育
以紅樹林、黑面琵鷺、水雉、鴛鴦、水獺、綠蠵龜等，為特定物種保育之項目。初期針對台南科工區爭取劃設四草保護區，以紅樹林的重要性向政府陳情，並獲得支持。因此直到現在，許多濕地的保護都是依靠紅樹林保育而打下基礎。
黑面琵鷺的保護，則是與七股濱南工業區同步進行的。
水雉則是因為高鐵經過水雉的棲息地，發現水雉剩下不到50隻，因此要求環評條件需進行生態補償，於是在官田台糖農地上建造人工淡水濕地，以進行水雉復育。目前成效斐然，官田水雉復育區約有70-80隻水雉，而台灣的水雉總數也成長到超過200隻以上。
3. 濕地復育與經營管理
整合河川之水文、環境，來推動濕地與流域的管理架構。自官田水雉復育區累積成功經驗之後，濕盟陸續認養高雄洲仔濕地公園、台南四草A1保護區，以及高屏溪右岸舊鐵橋人工濕地，進行濕地之營造、復育與管理工作。後續將繼續認養高雄半屏湖濕地公園、援中港濕地，以及推動高雄曹公圳流域之水文重建運動。
4. 環境教育
透過生態活動與導覽、網站建置，及發行「台灣濕地雜誌」，來進行濕地保育之宣導。也不定期舉辨研討會、培訓營，進行濕地保育之經驗交流與分享。
過去十年(1996-2006)，濕盟與相關保育團體合作，共同從事台灣海岸地區之環境敏感帶規劃、研究四草野生動物保護區劃設、嘉義鰲鼓濕地保衛戰、反濱南工業區及拯救黑面琵鷺、推動紅樹林復育運動、高屏溪與東港溪河川濕地保育、澎湖綠蠵龜棲地保護、設置水雉復育棲地、催生澄清湖鳥松濕地教育公園、推動設置高雄洲仔濕地公園、推動曹公圳水文重建等工作。
重要濕地之保育推動方面，我們成功劃設了台南市四草野生動物保護區(515.1公頃)、七股黑面琵鷺保護區(634公頃)、鳥松濕地公園(3公頃)、新市燕鴴保護區(50公頃)、官田水雉復育棲地(15公頃)、洲仔濕地公園(10公頃)、半屏湖濕地公園(12公頃)等。
在濕地之復育與經營管理部份，有下列4點：
1.結合特定物種之保育，包括塑造紅樹林成為濕地重點保育物種，促進保護區設置及河川濕地之保護。
2.成功營造官田水雉復育棲地，將水雉在台灣數量提高至200隻。
3.推動高雄洲仔濕地公園，成功達成「水雉返鄉計畫」，濕盟並進而認養使其成為高雄濕地生態廊道之重要核心。
4.推動高蹺鴴、黑面琵鷺作為濕地保育指標物種，濕盟認養四草保護區A1高蹺鴴繁殖區，進行濕地復育，營造成為台灣最大之高蹺鴴繁殖棲息區。
在環境教育與培訓方面，辨理培訓活動包括五屆「府城濕地生態解說師資培訓活動」、「四草野保區生態解說義工培訓」、「高屏溪水質保護志工」、「洲仔濕地導覽員培訓」等活動，已培訓超過500人次之解說義工。由濕盟進行生態解說服務人數也已超過三萬人次，並且協助台南縣七股鄉當地漁民，推廣濕地生態解說及七股潟湖生態旅遊。
在宣傳與推廣部份，設置台灣濕地全球資訊網www.wetland.org.tw，以推廣濕地網路教育。發行「台灣濕地」雜誌共61期，出版「搶救濕地」及「親近紅樹林的原鄉」等解說摺頁，「黑面琵鷺保護區劃設原則研討會」及「生態濕地在高雄研討會」等論文集，「台灣西南沿海貝類圖鑑」及「台灣西南沿海蟹類圖鑑」海報等文宣品。
濕盟更與各保育團體單位串連，包括協助成立「國際黑面琵鷺保育中心」，以推廣黑面琵鷺解說及保育觀念。與台南市政府合辦「親近紅樹林的原鄉」活動，與高雄市政府合辦「2004生態工法博覽會」、「2006高雄濕地生態廊道嘉年華會」、「生態濕地在高雄」研討會等，與高雄市中山大學合辦「第六屆亞太非政府組織環境會議」等。
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